相對於藍軍無論國、親、新三黨都已將二零零八的希望維系於馬英九一身，在「總統」候選人問題上呈現出空前的大團結、大共識，綠營卻是四分五散，爾虞我詐，明爭暗鬥。而由於民進黨主席一職有利於邁向二零零八「總統」之路，故在有可能會是十分激烈的「總統」候選人初選競爭之前，已陷入民進黨主席之爭。

民進黨在「三合一」選舉敗選後，黨主席蘇貞昌立即既是按照政治倫理及民進黨傳統，為敗選負責，也是兌現其在選前「倘黨籍候選人當選不過半即辭職」的信諾，而宣佈辭職。

《民主進步黨黨章》第十五條第三項規定，主席由全體黨員直接選舉產生，任期二年，連選得連任一次。主席出缺時，所餘任期 未滿一年，由中央執行委員互推一人代理；所餘任期超過一年，應擇期由全國黨員投票補選之。代理主席或補選產生之主席，其任期將至補滿原任期為止，任期超過一年者，視為一任。

但《民主進步黨黨章》第十五條之一第一項又規定，現任「總統」為本黨黨員時，自其就任之日起，為本黨主席，至其卸任之日止。其任期以「憲法」規定之「總統」任期為一任，不適用第十五條第三項關於任期的規定。

因此，這後一項本來就是專為陳水扁「黨政一體」度身訂造的條文內容，是最為適用於當今民進黨主席紛爭的態勢，即是由陳水扁本人再次以「總統」之身兼任執政民進黨主席，以化解黨內各個派系、各有企圖心人士為爭奪黨主席的紛爭。實際上，因按「憲法」規定已無資格再選「總統」的陳水扁兼任黨主席，可破解「黨主席是通向『總統』候選人的捷徑」的魔咒，而且可消除「既當裁判，又當球員」──既主持「總統」候選人初選選務，自己又參加「總統」候選人初選──的嫌疑。

但陳水扁並沒有這樣做。其原因，一來可能是三年前的「總統」兼黨主席的安排，有「黨國一體」之嫌，外界觀感不好，陳水扁不願再釐此渾水〔實際上陳水扁就是以此為由，宣佈「不再兼任黨主席的」〕；二來可能是今次民進黨在「三合一」選舉中慘敗，不但是黨外，就連是黨內也都將敗選的責任指向他陳水扁，而未來還有台北、高雄市長選舉和第七屆「立委」選舉，以目前國、民兩黨走勢看，民進黨仍有輸選的機會，屆時如是由他兼任直接負責選務操作的黨主席，所承受的壓力就將會更大，將直接影響他的「歷史定位」和「傳世英名」。

陳水扁不兼任黨主席，就給一群無論是否有二００八企圖心的資深民進黨人覬覦黨主席職務，提供了「便利」。於是，一場黨主席之爭，就不可避免地開打。

其實，早在黨主席正式由黨員直選產生之前，圍繞著代理主席職務的問題上，就已展開了主席爭奪戰的「前哨戰」。──按慣例，這個任期只有一個月的代理主席，應是由「立法院」民進黨黨團總召集人趙永清兼任。實際上，當年陳水扁辭去黨主席職務，在選舉產生新主席之前，就是由「立法院」民進黨黨團總召集人柯建銘出任。

本來，這個過渡型的代理主席職務，正因為是過渡型的，並無多少可供發揮的機會，有意參選黨主席者，未必會有意願，以避「職務衝突」嫌疑──既當主席選舉務選主持者，又參加主席選舉。於是，就利用呂秀蓮好出風頭的個性，及某些中執委「擁呂心切」的心理，故意放出「立法院」黨團總召集人趙永清「太嫩」，無法鎮得住黨內各派系的流言，而將呂秀蓮拱上了代理主席的「神台」。果然，呂秀蓮剛就職視事，就有人特別強調，依慣例代理黨主席都不參選黨主席。就此，應是截了呂秀蓮參選黨主席的後路。但「塞翁失馬，安知非福」，呂秀蓮失去參選黨主席的「東隅」，卻收到參加「總統」候選人初選正當性的「桑榆」。

由於蘇貞昌、謝長廷等最具資質參選黨主席的黨內主角，在這次「三合一」選舉中傷痕累累，已不可能再選黨主席，而且他們正暗中部署在後年參加「總統」候選人初選，為了避嫌也不會自尋煩惱。

考慮到民進黨的形象在這次「三合一」選舉中受到嚴重的損害，故陳水扁有意尋找沒有多少派系色彩，形象尚可，也未捲入選舉配聞的重量級人物出任黨主席。曾任「行政院長」的黨籍「立委」及海基會董事長張俊雄，就成了陳水扁口袋中的人選。豈料消息傳出後，張俊雄以「身體欠佳」及」集中精力做好海基會業務」為由，予以拒絕。於是，又打起了也是曾任「行政院長」，同樣也是黨內派系色彩不強，更同樣也是沒有捲入選戰「醜聞」的「總統府」秘書長游錫（方方土）的主意。

然而，游錫（方方土）的能力不強，這是公開的「秘密」。因此，有黨內人士認為，這有可能是陳水扁要在其「總統」任期的最後兩年加強對民進黨控制、「垂帘聽政」的手段之一。由於游錫（方方土）接任黨主席，將有利於「新潮流系」力拱的蘇昌貞角逐「總統」候選人之戰，故向來敢於向陳水扁說「不」的「新潮流系」，今次卻是「舉起雙腳」贊成，樂於在黨主席選舉選中，發揮其組織能力優勢，「義助」游錫（方方土）當選。

游錫（方方土）參選黨主席，還將得到陳水扁嫡系「正義連線」的全力支持。其原因很明顯，既然是派系大老的意思，派系當然要奉旨執行。由於「正義連線」和「新潮流系」是黨內兩個最大的派系，有這兩個派系「背書」，游錫（方方土）能夠高票當選，已是可以預期。

但仍有人蠢蠢欲動，「台獨聯盟」創辦人蔡同榮，就正式宣佈參選黨主席。但由於蔡同榮的「台獨」色彩過於鮮明，也由於他是黨內孤烏，更沒有得到陳水扁的「祝福」，故他當選的機率並不高。因此，估計他是要以參選黨主席為籌碼，換取其他方面的利益。

呂秀蓮自恃得到要為謝長這「護航」的「福利國連線」的支持，也有意參選黨主席。但由於本文開頭所述「避嫌」的原因，她如參選黨主席，就必須辭去代理主席，這就勢將要有一位「代理代理黨主席」接管黨務，似有不便。再加上她在黨內的人緣並不佳，當選機率也將會是很低。故此，一向自以為是的呂秀蓮，這次卻是有」自知之明」，公開聲稱不會參選黨主席。