正當包括卓榮泰在內的台灣當局喋喋不休地誇耀現在是「台美關係史上最好時刻」之際，美國總統特朗普簽署行政命令，正式宣布對全球多國實施關稅新政策，對包括對貿易夥伴設立百分之十的最低基準關稅，並對某些貿易夥伴徵收更高關稅，其中對台灣地區課以百分之三十二的高稅率，這比與台灣地區對美貿易有著高度相似性的日本、韓國還要高得多；而且對台灣當局實施「新南向政策」的東南亞諸國的新增稅率更高，等於是封閉了台灣地區對美貿易的後路。特朗普宣布的這項加徵百分之三十二關稅措施，不但等於是《台美二十一世紀貿易倡議》失效，而且還將會導致台灣地區的GDP下滑約三點八個百分點。這對聲言要「抱美國大腿」的民進黨當局來說，不啻是當頭重擊。
  由於民進黨當局對特朗普的這項加稅措施在事先是思想準備不足，以為既然台灣當局已經部署「台積電」到美國投資設廠，因而對台灣地區的加稅幅度，只是普遍性的百分之十基本關稅，因而卓榮泰在前一晚還要大家「安心入睡」；在事後卻驚慌失措，束手無策，卻又找不到與美國交涉的管道，因而府院官員在特朗普宣布加稅的當天全部神隱起來。賴清德在等了一整天後，只是在臉書發文「我也請院長指示相關部門，持續與美方強力交涉」。
  既然賴清德「有令」，卓榮泰昨日下午召開記者會，不得不承認「我們來晚了」，並在承認特朗普加稅措施將會對台灣地區的電子資訊、鋼鐵、金屬、機械、汽車，尤其是零組件、建材，還有家電等，以及蝴蝶蘭、毛豆、茶葉，還有漁業的吳郭魚、鬼頭刀、鱸魚等產業造成重大影響，導致消費市場縮小或減少競爭優勢力的同時，宣布了九大面向及二十項措施協助方案，總經費八百八十億元新台幣，其中工業七百億元、農業一百八十億元。卓榮泰又表示，下週他將主動邀請「國會」朝野共商「國是」，希望大家用最高的共識、最快的速度，經由特別條例，編定特別預算，同時針對今年度「中央政府」總預算該做合理的調適，一併做檢討。卓榮泰還聲稱，已經「啟動與美方全方位溝通」。
  然而，卓榮泰的這番應對措施，不但是遭到在野黨的強烈批評，而且財經專家們也「唔收貨」。國民黨主席朱立倫認為這些措施只能是短期措施，「止唔到咳」，民眾黨主席黃國昌稱卓榮泰都到這個節骨眼了仍是束手無策，沒有事前計畫、沒有事後對策，整場記者會全部在說空話，「腦袋裡想的只有如何進行自己的閣揆保衛戰，也無怪乎連綠色媒體人，都喊出要卓榮泰趕快回家睡覺！」因而他公開指出卓榮泰不該繼續擔任「行政院長」，亦即必須下台負責。
  民眾黨「立委」張啓楷也提到，特朗普對台灣地區扔出高達百分之三十二的高關稅核彈，顯示台灣地區長久以來對美國百依百順，甚至過於樂觀的政策是錯誤的，台灣當局要嚴正交涉，爭取台灣該有的權益，另外，也急需一個強而有力的財經內閣。張啓楷認為，卓榮泰在特朗普公布新關稅的前一個晚上，還要大家安心睡，一方面是因為卓榮泰在財經方面專業上的不足，又熱衷於政治鬥爭，才會又錯估情勢。為此，張啓楷呼籲，現在應該改組「內閣」，從業界找來對財經比較瞭解的童子賢或是朱敬一，重新改組，以因應新的高關稅核彈。
  俗語說，「好話唔靈醜話靈」，說不准，一直倔強僵硬的賴清德，這次將會對在野黨的訴求「從善如流」，果真會接受「改組內閣」的建議，讓卓榮泰下台。
  但賴清德卻將又不會按照在野黨的建議，讓財經專家「組閣」，而極有可能將會是指派現任「總統府秘書長」的潘孟安出任「行政院長」，以確保台灣地區的行政權力，真正掌握在自己的手中。
  實際上，賴清德在勝選「二零二八」後，當初的「行政院長」人選就不是卓榮泰，而是潘孟安，因為潘孟安與自己都是屬於「新潮流系」更是「南流」，較為放心，而且潘孟安曾經擔任過屏東縣長，具有一定的行政能力；另外，潘孟安也曾在「立委」任上擔任過民進黨黨團的書記長與幹事長，對「立法院」的生態及議事程序較為熟悉，有利於「行政院」與「立法院」的溝通。而卓榮泰在黨內派系上，曾經是與「新潮流系」相對峙的「福利國連線」亦即後來的「謝系」的重要成員。在「謝系」式微後，與羅文嘉等新組「民主活水」，與賴清德的派系關係並不親密。
  只不過是，一方面賴清德感念卓榮泰在擔任民進黨主席期間，在民進黨「二零二零」大選前的黨內初選過程中，頂住壓力處理「蔡賴之爭」，在「二零二四」大選中又成功輔選賴清德，因而賴清德勝選後委任他為「行政院長」，帶有一定程度的「酬庸」性質。但賴清德心中的「行政院長」人選，卻是潘孟安，只是在剛「走馬上任」時，需要潘孟安做自己的「大管家」，協調好各方的關係。現在，賴清德已經基本站穩腳跟，就是執行原先的設想的時候了。因此，在這次台灣當局應對特朗普加稅的失誤，可能就是賴清德「改組內閣」的最佳藉口及最佳時機。估計，在「五二零」賴清德上台一周年時，「改組內閣」的方案就會出台。
  讓卓榮泰必須下台的另一個原因，是卓榮泰昨日「主動邀請『國會』朝野共商『國是』」的宣示，可能會被視為僭越賴清德的權限。實際上，按照台灣地區的「憲制」及過去慣例，只有「總統」才有權召集及主持「國是會議」。卓榮泰昨日的宣示，即使是沒有「僭越」之心，但也用錯了政治術語，這是政治倫理的大忌。