在公共建設局展開對澳門輕軌未來發展策略的意見收集，並公佈了澳門輕軌整體輕軌線路藍圖將增加六條走線之後,由於其中列為中期推進的南線走向，「繞過」此前第一期計劃途徑的外港碼頭，因而引發個別人士「政府是否會取消外港碼頭」的疑慮。不過，從種種跡象看，特區政府不但不會撤銷外港碼頭，相反還將會採取各種措施，維持及增強外港碼頭的既有功能，並推動其與北安碼頭發揮互補作用。
  其實，有「撤銷外港碼頭」的疑慮，並非是「空穴來風」。在此前，至少曾經有過兩次「撤銷外港碼頭」的「前景危機」。其一是當初北安臨時客運碼頭工程動工時，時任運輸工務司司長的歐文龍，就曾經有過「語焉不詳」的由北安碼頭「取代」外港碼頭的設想。其二是二零一一年十一月在《新城區總體規劃草案諮詢文本》的第二階段公眾諮詢中，新城區「Ａ區」的兩個方案，其一有「外港休閒灣區」的安排，並建議搬遷外港客運碼頭。專家小組主張，一是在新城「Ａ區」南部另建新客運碼頭，外港碼頭改變功能；二是在港珠澳大橋人工島南部興建新客運碼頭，外港碼頭改變功能。這個建議反應熱烈，意見對立尖銳。在兩個月諮詢期內所收集的三千多條意見中，有二百三十二條是關於外港客運碼頭去留問題的，數量僅次於交通和公共設施兩項議題，位列第三。在收到的二百三十二條意見中，支持保留、建議搬遷、中立三種意見均有，當中較多傾向保留。尤其是「澳娛」的子公司「澳博」，及作為「澳博」的衛星賭場漁人碼頭最為反對，因而「海立方」、「回力球」及漁人碼頭的賭場，與外港碼頭近在咫尺，香港客人登岸後，透過高架走廊，就可步行到上述賭場。甚至當時有一個說法，一些香港家庭婦女，在乘船到上述賭場「小注可怡情」之後再乘船返香港，也不會耽誤其「買餸煮飯」。
  正因為是「澳博」和漁人碼頭的極力反對，專家小組才收回搬遷外港碼頭的設想。
  當時專家小組建議搬遷外港碼頭，是基於在友誼大橋落成及客輪班次增多後，港池迴旋空間受到較大制約，通航安全管理難以得到最高保障，尤其是在大霧天氣能見度不良時受到影響最大。而且，碼頭前地方公共交通面積不足，旅遊巴無處可泊，尤其是在每年一度的格欄披士大賽車期間，外港碼頭的陸上交通特別困難。而在長遠來看，在新城區「Ａ區」及港珠澳大橋人工島建成後，外港碼頭更是被層層包圍，外港就變成了「內港」，港池迴旋空間更是被嚴重擠壓，對航行安全的威脅更大。
  現在，雖然外港客運碼頭的客運量逐漸被北安碼頭及港珠澳大橋「分流」，但涵蓋交通、經濟、歷史文化與城市發展等層面的原因，保留外港碼頭仍然具有多方面的必要性。而且，AB通道已經確定以海底隧道形式興建並與輕軌南線合併，對外港碼頭港池條件的進一步制約已經消除。另外，雖然漁人碼頭的衛星賭場已經依法關閉，但其客源可由距離外港碼頭更近的「海立方」等吸納。正因為如此，從種種公開資訊看，特區政府並沒有「撤銷外港碼頭」的計劃，相反可能會充分調動其「積極性」，以利於其與北安碼頭發揮互補作用。實際上，二零二四年六月特區政府將外港客運碼頭的營運專營權批給「澳娛」，為期五年，就等於是宣示在中短期內仍然保留外港碼頭。
  外港碼頭自一九九三年投入服務以來，歷經多次優化升級，已深度融入澳門的交通網絡、文旅生態與城市發展脈絡。即便面臨氹仔客運碼頭的分流及港珠澳大橋的競爭，保留外港碼頭仍具有不可替代的現實意義與長遠價值，其必要性體現在多個核心維度。
  其一是區域交通樞紐的功能不可替代。外港碼頭作為澳門半島核心客運口岸，承擔著連接港澳及內地重要城市的關鍵職能，是區域交通網絡的重要節點。尤其是外港碼頭上澳門與香港之間海上客運的最主要口岸之一，每日有大量旅客通過此碼頭往返兩地。航程約一小時，比陸路經港珠澳大橋更便捷（尤其對前往香港市區者而言）。而且，外港碼頭位於澳門半島新口岸填海區，毗鄰葡京、新葡京、永利等核心商業與旅遊區，交通便利，無需長途接駁。
  其二是外港碼頭是澳門旅遊業關鍵入口，支撐旅遊與經濟發展。澳門作為國際旅遊休閒中心，每年接待數千萬旅客。外港碼頭是許多自由行及團體遊旅客的首選入境點，尤其適合在香港旅遊後轉來澳門的國際旅客。外港碼頭的存在強化了澳門與大灣區城市的「一小時生活圈」，有利於商務、會展、娛樂等產業人流往來。而且碼頭天台設有直升機停機坪，提供高端快速交通選擇（如直飛香港上環），滿足高淨值客戶與緊急運輸需求。
  其三是從城市發展風險防控角度，保留外港碼頭有助於提升交通系統的韌性。作為經歷多年運營檢驗的成熟口岸，外港碼頭在應急疏散、客流分流等場景中具有重要作用，尤其在旅遊旺季或突發情況下，能夠為城市交通提供緩衝空間，保障社會運轉穩定。在「萬一」北安碼頭遇到「突發」故障時，仍然有外港碼頭作為海上對外口岸繼續開放，這也是「居安思危」的體現。
  其四是作為歷史傳承與城市記憶的鮮活見證。外港碼頭的歷史價值，不僅在於其近三十年的運營歷程，更承載著澳門港口發展的百年脈絡。外港碼頭的發展軌跡與澳門從傳統港口城市向現代化旅遊都市的轉型歷程深度綁定。它見證了港澳兩地人員往來的日益密切，承載了無數市民與旅客的出行記憶，成為澳門城市身份的重要符號，保留外港碼頭並非固守傳統，而是在城市發展中留住歷史根脈，讓碼頭不僅成為交通樞紐，更成為展示澳門港口文化、傳承城市記憶的重要載體，增強市民的文化認同感與歸屬感。
  綜上，澳門外港碼頭在區域交通、文旅發展、城市佈局及歷史傳承等方面均具有不可替代的價值。因此，外港碼頭因與北安碼頭發揮互補作用，作為澳門對外海上客運的核心樞紐，憑藉各自的區位優勢、功能定位與航線佈局，形成錯位發展、高效协同的互補格局，共同撐起澳門與香港、珠三角地區的航運聯絡網，為澳門旅遊業與城市發展提供堅實支撐。兩者的互補作用體現在區位覆蓋、功能分擔、航線優化及設施配套等多個維度，實現了資源整合與效能最大化。
  功能定位的差異化的是兩碼頭互補的核心邏輯。在航線與流量調配方面，兩碼頭的協同運作將能有效提升澳門海上客運的整體承載力與靈活性。外港碼頭深耕澳門半島，助力老城區旅遊與商業活力延續；北安碼頭則緊扣路氹城開發與機場樞紐建設，推動澳門旅遊業向「半島+路氹」雙核驅動模式升級。這種錯位發展格局，既能避免同質化競爭，又能實現資源優化配置，使得澳門能夠更好地承接來自香港、珠三角及海外的旅客，強化其區域旅遊與交通樞紐地位。隨著澳門輕軌等交通網絡的進一步完善，兩碼頭的聯動效應將更為凸顯，持續為澳門的經濟社會發展注入動力。