屬於「福利國連線」的民進黨籍「立委」李俊毅關於「泛綠整併」的建議，其實質目的是要把台聯黨收納進民進黨，並使其成為民進黨內的一個派系。實際上，一些民進黨籍的「立委」，就作出了這樣的解讀。而台聯黨「立法院」黨團，也以此理由來對李俊毅的建議作出強烈反彈。

在理論上來說，將台聯黨收納為民進黨的一個派系，並非是沒有前例。實際上，近日傳出在廈門被毆／砍傷的朱高正，當年就是以黨主席的身份，率領中華社會民主黨投奔民進黨，並在民進黨內形成一個小派系的。而民進黨確實也是應驗了「黨內無派，千奇百怪」評語的政黨，從成立時的主要由黨外公共政策研究會及黨外編輯作家聯誼會兩大派系各踞要津；發展為「康系」、「前進系」、「美麗島系」、「新潮流系」各領風騷；進而由「美麗島派」與「新潮流系」雄踞對峙，實施「派系共治」；到陸續出現「正義連線」、「福利國連線」，及「台獨聯盟」加盟；在許信良與張俊宏「割袍斷義」後，「美麗島系」分裂成「新世紀」和「新動力」，並因「美麗島系」迅速泡沫化，「新潮流系」一派獨大，黨內其他派系合組鬆散的「主流聯盟」與之抗衡；一路走來，都是一部派系合縱連橫的紛爭史。因此，如果台聯黨愿意實行「泛綠整併」，並合併進民進黨，它作為民進黨內的一個派系存在，就象原來是主體性政團、現卻是民進黨內的一個派系的「台獨聯盟」那樣，是並不出奇的。

但問題是，與民進黨合併，並不符合台聯黨精神領袖李登輝的創黨動機。──李登輝當年之所以要創辦台聯黨，其目的有二：其一是要將台聯黨作為自己的「護身符」，透過各種公職選舉展示其政治實力之後，右可抗衡中國國民黨藉「黨產」等問題的「追殺」，左可擊破民進黨追查「國安秘賬」的狙擊，以求自保；其二是面對左右搖擺、始終無法下定決定「正名、制憲」的陳水扁，李登輝要以堅持「台獨」基本教義的台聯黨，來牽制、監督民進黨。如果台聯黨合併於民進黨，李登輝就將會失去「護身符」，並將會被「消音」，不利於本土意識的發展。

其實，即使是台聯黨並未有被民進黨併吞，陳水扁就已有意向老是要騎在他頭上做「老子」的李登輝「開刀」了。──二００三年曾一度意圖藉「國安秘賬」動一下李登輝，後來因考慮到二００四年的「總統」選舉，仍需借助台聯黨，而強忍不發，但卻也藉收押劉泰英來「殺雞儆猴」；半個多月前陳水扁接受三立電視台專訪，指眼篤鼻地大罵李登輝，雖然有議論指是陳水扁要為自己「登陸」向北京表態，但也不無在自己已無選舉壓力之下，要向李登輝進行「總算帳」之意。

因此，無論如何，李登輝都是要堅持台聯黨的「自主性」，決不會整併進民進黨的。相反，李登輝倒是要以台聯黨為基礎，製造另一個「泛綠大黨」，以實現兩個「泛綠大黨」之間的互相制衡，形成「泛綠政制」下的兩黨政治。

實際上，李登輝是贊成並追求「兩黨制」的，認為只有實現兩大政黨之間的互相制衡、監督，及常態化的政黨輪替，才能防止政治腐敗，推動「國家」進步。但是，他所追求的「兩黨制」，並不是現時「修憲案」中的「單一選區兩黨制」，將會催生為民進黨與國民黨之間的兩大黨，因而將會使台聯黨泡沫化。而是以民進黨為一方，另以台聯黨和國民黨為一方，組成另一個「泛綠大黨」──「台灣國民黨」，形成兩個「泛綠大黨」的對立、制衡、輪替。具體的做法是，透過扶助王金平，讓其奪得國民黨領導權之後，再慢慢地將中國國民黨改造成為「台灣國民黨」，然後就實現其與台聯黨的合併。

本來，在二００四年底的「立委」選舉前夕，按照當時台島的政治生態及選情研析，「泛藍」將難以過半，單靠「泛藍立委」的力量，王金平難以保住「立法院長」。此時李登輝就將會「出手」，指揮台聯黨籍「立委」「義助」王金平，讓其得以蟬聯「立法院長」，再進而以此為政治籌碼，贏得國民黨主席選舉。但李登輝「義助」王金平，是有交換條件的，就是他當選為國民黨主席後，必須聽從李登輝指揮，「綠化」國民黨。後來，因為「泛藍」過半，王金平單憑「泛藍立委」的力量就可拿下「立法院長」，而無須依靠李登輝的「義助」，才使李登輝的這一政治圖謀無法施展。正因為李登輝曾有過藉王金平來「綠化」國民黨的圖謀，也因為王金平與李登輝的私人關係相當密切，而王金平對參選國民黨主席又表現得特別的熱心，才成為連戰對是否卸任國民黨主席猶豫不決、優柔寡斷的重要原因之一。

然而，李登輝要與陳水扁「劃清界線」，並不等於是台聯黨高級黨工也愿與陳水扁分道揚鏕。現任台聯黨主席的蘇進強，就因與陳水扁的私誼甚篤，並曾被陳水扁委任為「國安會」諮詢委員、中華文化復興運動總會秘書長〔會長為陳水扁兼任〕，而讓李登輝對他的忠誠度有所懷疑，曾提醒他「不要憨憨」，甚至還以「不要以為我不會再組一個黨」來警告之。這也就是為何蘇進強日前曾嚷嚷要在年底的縣市長選舉中大量提名，向民進黨「全面開戰」，寧為玉碎不為瓦全，並宣示台聯黨絕不會在台南縣長選舉一役中缺席的重要背景原因：公開向李登輝撇清自己與陳水扁的關係。