一直以來，馬英九予人的印象，是為人正直清廉認真，是「清官」、「賢官」的樣板，但其行政能力及策略權謀以至應急能力，則是有所不逮，不一定是一位「能官」，因而在「賢」、「能」兩者之間，可能會互相沖抵。實際上，自他就職後不到一個月，就發生了一系列不利於他「能」方面形象的事件，令他的聲望如「跳水」，急速下跌。正當海基會前往北京與海協談判，簽署了「周末包機」和「大陸居民赴台旅遊」兩項協議，使他的聲望有所回升之際，又發生了台北縣海釣船「聯合號」在釣魚台海域遭日本巡邏艦撞沉事件，馬政權的「外交」部門以至曾是「保釣英雄」的馬英九本人的反應，都予人進退失據的感覺。如馬政權在此事件上再失分，馬英九上台後的民望，可能還不如陳水扁－－畢竟陳水扁剛上台時，民意支持度曾高達百分之七十以上，而且此紀錄曾保持了四個月之久，只是到了「核四事件」才頹然崩塌，而馬英九上台後未到滿周月，即民望急跌。不過，如果馬英九處置得當，壞事也可變好事，在展現其民族氣節及錚錚風骨，及軟硬有度的涉外鬥爭藝術的同時，也可藉機清掃陳水扁安插在「外交」系統的「扁家軍」以至「台獨」悍將，消除後患。

其中最核心的處置方式，是「召回」台灣駐日代表許世楷。目前，台灣「外交部」將許世楷「召回」，定位尚未明確，仍留有模糊空間，亦即留下迴旋餘地。既有解釋是「請他回來解釋事件」的，也有說是為展現不滿日本調查報告的。但由於「外交部」的「新聞稿」是使用「召回」的術語，這就並非是「解釋事件」或「外交表態」那麼簡單。

實際上，按照錢其琛主編、世界知識出版社出版的《世界外交大辭典》一書詮釋，「召回外交代表」，系指派遣國政府將其駐外使節召回國內。在正常情況下，大多由於使節任期屆滿，另有任用；或由於使節退休、離職等個人原因。但有時是由於兩國關係惡化，召回外交代表成為派遣國政府所採取的一種最嚴重的外交步驟；或因為該外交代表被駐在國政府宣佈為不受歡迎的人，應駐在國的要求予以召回。而目前的情況，許世楷既非「任期屆滿」，另有任用，也非「退休、離職」，更非「被駐在國政府宣佈為不受歡迎的人」，故其被「召回」，就應當是按「兩國關係惡化，召回外交代表成為派遣國政府所採取的一種嚴重的外交步的方向解讀。

但是，「外交部長」歐鴻鍊及「新聞局長」史亞平卻刻意將此項「召回」行為模糊化，聲稱只是讓許世楷「返台報告情況」，顯然是反映了馬政權尚不願也未打算與日本「撕臉」。因此，這個「召回」，很可能是藉機撤換許世楷，並進而落實馬政權要清理駐外人員中的「扁家軍」悍將的先聲。

其實，馬政權早就有意清理整肅「扁家軍」在「外交」系統中的悍將。實際上，陳水扁上台八年來，盡管苦於民進黨缺乏「外交」人才，從「外交部」到駐外人員，都不得不繼續使用過去國民黨體系培養出來的藍色「外交」人員，但派駐重要國家的代表，卻不管其人是否「外交」專業出身，都陸續派出民進黨人或「台獨」人士出任，如美國的吳釗燮，日本的許世楷，意大利的鄭欣，德國的尤清，巴林的張旭成，新加坡的郭時南，斐濟的尤哈尼，歐盟的高英茂等。馬英九在「三•二二」大選中當選「總統」後，陳水扁仍要安插「二十多名「自己人」出任駐外代表，如李南陽之於愛爾蘭，趙麟之於斯威士蘭等。

這些「台獨」悍將留在「外交」系統重要位置，肯定不利於馬英九對外政策的貫徹落實，但又苦於沒有撤換他們的藉口。正在此時，民進黨「立委」發起攻擊國民黨籍政務官及「立委」的「國藉」及「綠卡」戰役，意圖進一步打擊馬英九的聲望。此舉正如民進黨籍「立委」管碧玲控告馬英九的「特支費」案，卻反過來令到自己的丈夫許陽明被檢控利用「特支費」貪污那樣，不啻是「搬起石頭打自己的腳」，讓馬政權逮住了反擊的機會，由「外交部」發佈「新聞稿」，公佈了陳水扁所任命的四名「獨派」「外交官」，擁有雙重「國籍」或外國居留權，其中就包括了許世楷。馬政權這一招，除了是「以子之矛攻子之盾」，消解民進黨的「綠卡」攻勢之外，也是要藉此迫逼這些「獨派」人士按民進黨人自己的標準，自動辭職。

恰在此時，發生了「聯合號」海釣船在釣台海域遭日本海巡艦撞沉事件。而據報導，台灣「海巡署」本已進入釣魚台海域救援「聯合號」的海巡艇之所以突然撤離，就是源自許世楷的「日本反應報告」。很明顯，馬政權以「召回」許世楷的方式作「危機處理」，是「一箭多雕」之舉：一是要「連消帶打」，反擊民進黨人對「海巡署」撤出釣魚台海域事態的攻擊，以轉移鬥爭視線；二是正如前述，在公佈許世楷擁有日本居留權的基礎上，再踩上「謊報軍情」的一腳，並將「報告要求海巡署撤艇」與「日本居留權」掛聯起來，暗示真正「賣國」的是許世楷，既痛快地反擊了「綠卡」風波，又置許世楷於死地，為撤換他取得正當性；三是進而彰顯了陳水扁所安插的「外交官」擁有外國居留權，在「忠誠度缺乏」方面的嚴重性，為迫逼同樣擁有外國否留權甚至是雙重「國藉」的「扁家軍」張旭成、劉寬平、周叔夜等人預作輿論鋪墊。

許世楷是藍軍恨之入骨的「獨派大將」。據由全國台灣研究會副秘書長楊立憲主編、九州出版社出版的《「台獨」組織與人物》一書所載，許世楷長期進行「台獨」活動，曾任「台獨聯盟」主席。為此，他曾被國民黨當局列入禁止入境「黑名單」。「黑名單」解除後，他返台灣定居，繼續從事「台獨」活動，起草《台灣共和國憲法草案》，並任「台灣國民制憲運動委員會」主任，也曾出任建國黨主席。在被陳水扁委任為駐日本「代表」後，雖然也曾做了一些實事如爭取到台灣民眾赴日旅行免簽證等，但卻也積極遊說日本政府和國會制訂「與台灣關係法」。這樣的「台獨」份子，對要推行傳統的「中華民國國家定位」「外交路線」的馬政權來說，有如一枚定時炸彈。因此，「外交部」在已宣佈許世楷擁有日本居留權的基礎上，以「聯合號」事件名意義「召回」許世楷，等於是要迫使他自動辭職。這或許是馬政權在此次「聯合號」事件中，除了是改變世人對馬英九「應變能力不強」的形象之外，最大的收獲。