蔡英文按照民進黨的傳統，在「總統」大選失利後宣佈辭去主席職務。但為利於工作起見，留任至二月二十九日。這就將導致產生兩個問題，其一，是從三月一日起至五月間的新任主席就職止，必須由一位代理主席統管黨務；其二、必須選舉產生新主席，而這已定於五月二十七日進行。

其實，嚴格來說，蔡英文的「引咎辭職」，似是「多此一舉」。一方面，民進黨雖然在「總統」大選中失利，但在「立委」選舉中卻可算是大有斬獲，取得二十七席區域「立委」，十三席不分區「立委」，共四十席，佔總議席的百分之三十五，比上屆大有進步。尤其是攻破了幾個「藍大於綠」的選區，包括台中市東西南區的林佳龍氣走老將黃義交；彰化縣第四選區的魏明穀打敗蕭景田，台東縣的劉櫂豪趕走了饒慶鈴，澎湖縣的楊掀翻了林炳坤等。而且，國民黨的幾位超級戰將林益世、邱毅、周守訓等都落了選。因而可說是扯平，彌補了「總統」大選的失利，不必辭職。

另一方面，按照《民主進步黨黨章》第十五條第三款規定，民進黨在在野時，「主席由全體黨員直接選舉產生，任期二年，連選得連任一次。主席出缺時，所餘任期未滿一年，由中央執行委員互推一人代理；所餘任期超過一年，應擇期由全國黨員投票補選之。代理主席或補選產生之主席，其任期均至補滿原任期為止，任期超過一年者，視為一任。」而蔡英文從二零零八年起，已連續出任兩任黨主席，其正常任期也是到今年五月間為止。因此，即使是她不辭職，其任期也已剩下不多，而且也不可能再競選下一任黨主席。這就使人對她的辭職，有多此一舉的感覺。

據說，蔡英文為安定選後綠營的低迷氣氛，曾於農曆大年初三親自勸進陳菊考慮接下重擔出任代理主席，但陳菊並未給予正面答案，一切仍等待她點頭。

然而，這只是徵詢意見而已，她並不能任命陳菊出任代理黨主席，因為依據民進黨內規規定，縣市首長為當然中常委，如果黨主席在位因故不克參加中常會，可由主席指派一名中常委代理黨主席，但蔡英文是宣佈辭職，不得再自行指派代理人，必須由中執委互相推選產生代理黨主席。因此，準確的說法，應是她動員陳菊出來參加代理黨主席互選。

如果要說出任代理黨主席必須具有資格，陳菊確實是完全有資格。因為她是民進黨十八名創黨成員之一，資格甚老，而且組織能力不弱。民進黨的大型集會，如由她當主持，氣氛將會甚佳。何況，由高雄市長身份出任黨主席，已有謝長廷的先例。但是，陳菊的身體欠佳，曾經中過風，前年台風襲台時，她體力不支，返回官邸休息，而鬧出了大風波。而高雄市距離中央黨部所在的臺北市又較遠，她不可能「蠟燭兩頭燒」。而且，陳菊是「新潮流系」的創流元老，當年她競選高雄市長時，「新系」傾巢南下助選，當選後又有大批「新系」流員進駐高雄市政府，已經引起黨內側目，倘她出任代理黨主席，未必能服眾。因此，她的推辭也就是情理中的。

按照過去經驗，當黨主席離境、出差，參與黨內初選不克出席時，都由民進黨「立法院」黨團總召柯建銘代理黨主席。但柯建銘的「扁系」色彩甚濃，這次「總統」大選已證明「陳水扁牌」已是「票房毒藥」，黨內避之不及。而且，新一屆「立法院」剛成立，民進黨黨團自我期待能對馬政府起到牽製作用，為避免柯建銘身兼二職影響民進黨「立法院」黨團的戰力，也不適宜出任代理主席。

目前在中常委中曾任黨主席的，有謝長廷。但顯然他目前並無此意願。而傳出有意接任代理主席並參選黨主席的，則有蘇貞昌、賴清德、蘇治芬、蘇煥智等人。另外，也有傳說，為實現「世代交替」，蔡英文寄望蕭美琴參選黨主席。

這就將形成一幅有趣的畫面，因為在上述被「點名」的人士中，除蘇治芬之外，都是「新系」或親「新系」人士。其中陳菊、賴清德是「新系」資深流員，蘇貞昌是「新系」力挺之人，蕭美琴則是親「新系」，因而在二零零八年的「立委」黨內初選中，她被視為「十一寇」之一，被打翻在地。蘇煥智雖然已退出「新系」，但仍被視為是「新系」成員。黨主席之爭，就將會是「新系」的內部競爭了。

這就將會遇到一道難以跨過的「坎」。「新系」雖然紀律嚴明，影響力大，但人數不多，且在黨內遭到其他派系的忌恨。游錫出任黨主席之時，主導黨代會通過了解散派系的決議，就是覷準了黨內其他派系忌恨「新系」的心理而操作的。因此，即使是「新系」只有一名參選者參加黨主席直選，都可能鬥不過其他派系，何況「新系」還有這麼多人參選？當然，如果全部參選者都是「新系」，沒有其他派系人士，那麼，黨員們在沒有其他選擇之下，也就只能是從中挑揀一人了。但是，因此又將會導致投票率超低，甚或是即使有前往投票，也將會投下廢票或空白票。

其實，民進黨在忙於推選代理黨主席及選舉新一屆黨主席的同時，更應檢討敗選的原因。實際上，馬英九在勝選之後，銳意改革，呈現一片「向上提升」的氛圍。但民進黨內卻是萎蔫不振，甚至連蔡英文也要到二月底才提出敗選檢討報告，這與過去的明快作風相比，真是令人有「向下沉淪」之感。在黨內對敗選有兩個不同觀點之時，倘若不及早作出結論，並科學地找出失利的真正原因，加以改進，在藍綠基本盤已經固化之下，就將永遠是在野黨。

不過，蔡英文總算是明確指示，民進黨將會增設常態性的「選舉研究中心」。

而過去民進黨中央也曾設立「選舉對策委員會」，首任執行長為遊盈隆，後來卻廢掉了該單位。這恐怕也是民進黨的選票開得不理想的原因之一。實際上，在「總統」大選過程中，遊盈隆所作的民調是綠營幾個民調單位中最為準確的，也較為接近開票的結果。為此，他曾多次以其民調提醒蔡英文，但因為與綠營其他民調單位的「蔡英文將贏二十五票」樂觀預測相比，遊盈隆的民調卻是蔡英文將輸給馬英九，而遭到黨內唾罵。倘當時蔡英文能相信和接受遊盈隆的民調，及時調整策略，即使仍是會輸，也不會輸八十萬票這麼出乎意料之外。