由於菲律賓對解決其公務船射殺台灣漁民的事件缺乏誠意——在台灣「最後通牒」七十二小時最後期限的答覆，一沒有以菲律賓政府的名義向「中華民國政府」道歉，而只是以「人民」的名義向難屬進行個人式的道歉；二沒有作出以承認刑事罪行為基礎的賠償，而只是以人道主義的形式向難屬致送慰問金；三沒有承諾懲兇，而只是聲稱進行國家級的調查，但「調查」的結果不排除將會大事化小；四也沒有以政府的名義明確答允進行台菲漁業談判，而是以個人名義表示將會展開談判；因而由「行政院長」江宜樺一日內兩次舉行記者會，宣佈將制裁行動升級。

其中一次是在上午，宣佈府院高層早間召開「國安會議」，馬英九認為無法接受菲律賓如此輕率敷衍的態度，裁示立即啟動第一波制裁，實施「最後通牒」的凍結菲勞申請、召回台灣駐菲律賓代表，及要求菲律賓駐台代表返國協助妥善處理本案等三項制裁措施。與此同時，江宜樺又要求菲律賓必須下午六點前正式有誠意回應台灣「四項要求」。否則第二波八項反制措施，將於今天下午六點生效。由於菲律賓總統府下午所作的回應完全避重就輕，推卸責任，毫無誠意，馬英九極不滿意，當即主持「國安會議」並由江宜樺於下午六時的期限結束時召開記者會，並將之升級為國際記者會，還率同各相關部會首長出席。他宣佈，宣佈立即啟動對菲律賓的第二波八項制裁措施，並向台灣民眾提出三項呼籲：全體人民繼續團結一致，做為政府最有力的後盾；理性對待菲國人民及在台菲勞；爭取國際社會共同聲援。另外還宣佈，「國安會」已經成立「對菲律賓制裁措施應變監督小組」。

馬政府的強硬反應，受到藍綠朝野的支持。昨日中午舉行的民進黨中常會，還通過了支持馬政府向菲國提出的道歉、懲凶、賠償與展開漁權談判等四項要求。黨主席蘇貞昌表示，如果菲國政府仍無完整、具體回應，民進黨願做政府的後盾，支持對菲方採取相關制裁，必要時並提高制裁手段。而民進黨國際部主任劉世忠也表示，民進黨嚴正表達「不滿意、不接受、不妥協」的立場，要求馬政府持續升高對菲律賓政府的外交壓力，民進黨做為最大在野黨，願意做馬政府最強有力的後盾，「朝野一致對外」，要求菲國政府給予台灣滿意的答覆。不過，他也借助外界質疑「外交部」前晚「雖不滿意但可以接受」的態度昨晨被「總統府」推翻的事實批評指出，馬政府的決策體系出現令人憂心的混亂情況，因而「最後通牒」的七十二小時是白等了。

民進黨的反應折射了兩個事實，其一是菲律賓海岸警衛隊的暴行及菲方的輕慢態度，已經激起了全島民眾的激憤，同仇敵愾，這真是民氣可用。因此，台灣方面是可以做得更好的，而事實也已經證明，菲律賓只不過是一個三流國家，不但是經濟和軍事實力均難以與台灣地區相比（有說是光是台灣一艘紀德艦，就足可應對菲律賓的所有接收美國「二戰」退役軍艦的海軍），而且阿基諾三世在多次國際糾紛中，都被證明政治智慧不足，尤其是在香港旅遊團被槍手挾持事件中的表現，就令人感覺不是一國領袖的「材料」。因此，以台灣的實力和民眾的激昂情緒，菲律賓應能感受到強大的壓力，從而很有誠意地正面回應台方的「四點要求」，而不是嬉皮笑臉，虛應故事，含糊其辭，把台灣的「最後通牒」當作是兒戲。

其二是其實台灣方面的表現似是也好不到哪裡去，只不過是「五十步笑百步」而已。這裡，先不說馬政府在事件肇始後的「軟趴趴」了，就說是在民眾強烈反應，及民調顯示有七成以上民眾主張兩岸攜手合作懲罰菲律賓，馬英九擔心會再次發生兩岸攜手「保釣」的態勢，因而不得不在兩天之後才表現出強硬態度，卻又一下子就是升高到「最後通牒」的嚴重步驟，但又沒有立即採取配套措施施壓，只是在隔天之後再宣佈派出公務艦船護漁，及在肇事海域進行軍事演習。這就使得菲律賓沒有感受到太大的壓力，因而好整以暇，表現出有點「不屑」的態度。

其實，就是在「四項制裁措施」中，被馬政府視為最具威力的凍結菲律賓外勞，菲方也並不會太緊張。誠然，根據菲律賓國家統計局的數據，全國有大約一千萬人在海外務工，其匯回國內的匯款佔菲國家經濟總量的百分之十以上，是其主要外匯來源之一。而目前在台灣工作的菲律賓勞工約有八點七萬人，每年向菲律賓匯款金額達一點七億美元。但是，近年由於台灣薪金水平一直沒有調升，已有不少菲勞轉往新加坡和香港、中東、南韓。另外，由於印尼囿於國內因素，已經決定停止輸出女傭，因而台灣凍結菲傭，菲律賓並非無路可走，實際上菲律賓勞工部長就聲稱，萬一台灣實施制裁，就轉往中東南韓輸出勞工。何況，目前在台灣的菲勞只僅占其在全球菲勞的百分之零點八七；去年菲國一年透過海外勞工獲得的外匯為二百一十四美元，來自台灣的僅佔百分之零點八。因此，以凍結菲勞作制裁，菲方的反應卻是一副無所謂的樣子。而且必須看到的是，停用菲勞，就將更難聘請到薪金比菲勞更低廉的外勞，對台灣經濟也非好事。而台菲之間一直是貿易順差，經濟制裁對台灣經濟就將是「七傷拳」，未傷人先傷自己。盡管企業家出於顧全大局，支持政府，但必須承受短期損失。

另一個難以令人滿意的表現，是「外交部長」林永樂未能精準配合馬英九的戰略意圖。劉世忠雖然是以民進黨的邏輯質疑「府院高層推翻外交部」，但也不是完全沒有道理。實際上，菲律賓代表白熙禮返台後，林永樂竟然親自出馬與他談判，把自己的格局做小了。因為白熙禮的官階，充其量也只不過是一個司局級的官員，自己身為部長，就呈現出完全的「不對稱」，有失外交尊嚴。何況，台灣是有理的一方，根本無需以上駟對下駟，應是由菲方低聲下氣求上門來。而且，一談就是五個小時，超逾了七十二小時期限仍未能有結果，被牽住鼻子走，一個道歉聲明反反覆覆修改了四次，無法呈現台灣所具有的強勢。

更令人不明解的是，菲方明明是缺乏誠意，但在深夜的記者會上，林永樂卻處處為菲律賓緩頰，並片面擴大詮釋菲方的「誠意」。這看在政治情商本來就不高的菲律賓政府的眼中，難免會作出誤判，以為馬政府的嚴厲動作是「做假的」，因而更為有恃無恐。結果，馬政府得不到應有的戰利效果。

因此，馬政府必須緊緊把握目前仍然有利的態勢，向菲律賓施加壓力。即使是不便於與大陸軍方合作，也應施展強硬態度，在菲方平時對台灣漁民作威作福尤其是今次肇事的海域進行實彈演習，以至是效仿大陸軍方收復黃岩島的展示實力的辦法，實際控制幾個有利於護漁的島礁。這才能真正震懾菲方。