「國際合作」，又稱「國際技術合作」，是台灣當局主要的援外方式之一。其早期對外提供國際技術合作的目的，是在爭取非洲新興獨立國家支持台灣當局在聯合國的代表權。但自一九七一年聯合國大會通過了第二七五八號決議之後，台灣當局的國際技術合作重點逐漸轉移到中南美洲地區，由八個國家增加至十二個國家。與此同時，向非洲地區派遣技術團體則由二十四個國家萎縮為四個。而台灣當局派遣技術團體的主要對象，是與其有「邦交」的國家。其在台灣的中南美洲「邦交國」，全部都派遣有技術團體。對無「邦交」的中南美洲國家，則並無派遣技術團體，在非洲也是如此。因此反映了中南美洲仍然是台灣當局的「外交重鎮」，而且也證明了台灣對外技術援助與「外交」關係的主要關聯性。

正因為台灣對外技術援助的對象是「邦交國」，亦即繼續對這些「邦交國」派遣技術團體，被馬英九認為並無抵觸其「外交休兵」的政策，故對「邦交國」繼續執行對外援助計劃。在二零零九年度的財政預算案中，「外交部」為「國際合作」編列了一百三十億七千五百萬元新台幣的預算。主要以台灣與「友邦」簽訂雙邊合作計劃協定、議定書、備忘錄所列的義務、承諾或雙邊混合委員會會議相關決議為依據，另援外策略以推廣台灣經驗，切合受援國需求，以雙邊、多邊參與國際組織三面向，由「政府」及民間共同推動，以期達到落地生根、永續發展的目標。

據「外交部」政務次長夏立言月前向「立法院」外交及國防委員會所作的《外交部九十八年度「國際合作」預算解凍案口頭報告》顯示，台灣當局目前的「國際合作」辦理情況，在駐外交技術服務方面，多年來台灣當局透過國際合作發展基金會派駐的技術團，將台灣農漁技術及經驗與各國分享，並為各「友邦」儲訓各類技術人。目前台灣在亞太、亞西、非洲、中南美洲及加勒比海等地區的二十八國派遣技術團、醫療團、工業服務團及投資貿易團等計三十三團二百一十八人，因應各地區區域發展需求與特性，進行多元化援助計劃。

在加強雙邊及多邊合作方面，在亞太地區，依據各「友邦」需求的計晝內容，協助太平洋「友邦」國家進行基礎建設及改善國民生計。主要項目有：農漁牧林業的合作；援建國家硬體建設如機場、國會大樓、政府辦公大樓、體育館等；捐贈電腦設備或建立資訊中心；協助教育訓練及人才培育、鄉村或離島建設、中小企業發展、再生能源及廢棄物處理等。在亞西地區，辦理代訓中東國家專業技術人員及與沙地阿拉伯標準檢驗合作。其中與沙國的標準檢驗合作是以派遣專家前往授課及人員講習訓練交流方式進行，協助台灣產品外銷該國的便利性，擴大台灣對沙國貿易量，降低台灣對沙國的貿易逆差。另代訓專業技術人員方面，台灣每年代訓沙國職訓師約達一百二十人，促使沙國職訓機構瞭解台灣精密機械、電腦及汽車零件等產業。二零零五年至今沙國向台灣採購的訓練用工具機器設備金額達六千萬美元，有助台灣對沙國的整廠輸出，直接獲利者為台灣的製造業者。在非洲地區，中國大陸近年來對非積極 進行總體外交，包括提供非洲國家無 附帶條件的預算援助及巨額貸款、以倍數增長投資及貿易數額、進行大規模基礎工程建設、成立孔子學院等作為。台灣在非洲雖無需與中國大陸再進行外交角力，惟台灣身為已開發地區， 對開發中國家進行開發援助本為國際責任，確有必要持續積極提昇與「友邦」雙邊合作關係，如推動農業、公衛、職訓、基礎建設等民生建設，有效提昇臺灣援助之能見度，例如：臺、布(基納法索)成功開發巴格雷墾區一千八百公頃水稻田，曾獲法國國家「France 2」及「TV5」電視台廣泛報導，被譽為永續發展之典範。在歐洲地區，主要提供中東歐各國公共部門或民間團體小額援助，如捐贈波蘭中文教學用書法用品、電腦設備；贊助波蘭籌建故教宗若望保祿二世紀念中心；贊助斯洛伐克市立綜合醫院醫療器材；贊助拉脫維亞、立陶宛學校成立「台灣電腦教室」、殘障用電梯等。在中南美地區，台灣目前與中南美暨加勒比海地區十二個國家維持「外交」關係，佔台灣現有全世界二十三個「邦交國」半數以上。因中南美「邦交國」均屬開發中國家，亟需台灣提供各項協助，以落實其政府施政目標，如協助修築公路、水力發電；協建體育場、圖書館、資訊教育及捐贈電腦資訊設備；發展農漁牧業、糧食增產；職業技能訓練講習等，為落實「活路外交」政策，更應加強與「友邦」的各項協助與合作關係，集中資源全力鞏固與現有「邦交國」關係。

在擴大國際合作層面，建立多元援外體系方面，主要進行了以下幾方面的工作：一，有效運作「台灣一歐銀合作基金」，建立台灣與歐銀三十個受援國的實質聯繫。多年來台灣與歐銀合作在其受援國執行合作計劃達一百八十五件，與歐銀建立良好合作關係，透過與歐銀合作，協助歐銀受援國整體發展。另外透過歐銀合作機制，有助台灣廠商爭取歐銀計晝衍生的龐大商機，促進台灣經濟發展。二，深化「美洲國家組織」(OAS)所屬「美洲青年創業基金」(YABT)的合作，執行美洲青年創業競賽等計晝，協助美洲及加勒比海國家改善青年就業及貧窮問題，並透過「YABT」的管道參與「 OAS」相關會議及活動，設法建立參與「 OAS」的機制。三，執行中美洲經濟發展基金的協議，利用基金孳息執行的計晝包括：藉由分享成功經驗促進台灣與友好國家關係、擴大中美洲學生來台就讀獎學金及中美洲經貿辦事處營運計畫等，對加強台灣與中美洲友邦的商務往來及經貿合作關係。

在設置「台灣獎學金」方面，轉向側重培養各國人才來台接受大學以上的正式教育，對加強台灣與外國的學術交流，促進國際化，增進雙邊關係，提高台灣的能見度，具有正面意義。目前本部臺灣獎學金受獎生有六百七十四人，預計二零零九年九月新生入學後，人數將高達七百四十六人。