從台灣近年來的選戰實踐看，挑戰現任者的參選者的競選總部，一般都較早成立，以便能及早形成選戰氛圍，拉抬士氣；而爭取連任者則是好整以暇，等待挑戰者出招後才慢慢接招，後發制人。但是，今次「總統」選戰的情況卻有點怪異，相對於爭取連任的馬英九的競選總部－－「台灣加油讚」，已確定於端午後成立；而在明年「總統」大選已因決定與「立委」選舉合併進行而須提前兩個月投票的情況下，作為「挑戰者」的蔡英文的競選總部的成立日期，卻是一拖再拖，渾然不顧犯了選戰的大忌。
蔡英文的競選總部為何遲遲未能成立？有議論說是還未能擺平與蘇貞昌的關係，看來只是其中一個因素；而更重要的因素卻很有可能是，蔡英文的競選總部的組織班子，缺乏一位既能統籌全局又有輔選謀略的人士來總館其選戰，尤其是在是否重新起用「新潮流戰略之神」邱義仁的問題上猶豫不決，而耽誤了時機。
實際上，從這幾天來有關的報導中，就可以看出端倪。本月二十八日，政壇突然傳出消息，謂「扁朝」前「行政院長」張俊雄透露，二零零八年選後離開政壇，遠走高雄鄉間務農的「扁朝」前「國安會」秘書長邱義仁，將為二零一二年大選復出，加入民進黨的輔選陣容。對此，民進黨籍「立委」大作輿論予以配合，聲稱邱義仁在黨內的輩份高、資歷深，又是公認有謀略的軍師，在「行政院」副院長和祕書長任內，因為是決策級的人物，大家還私下稱他是「地下院長」。而且蔡英文、邱義仁兩人曾是前後任「副閣揆」，蔡英文擔任「陸委會」主委時，邱義仁擔任「行政院」祕書長，兩人過去有一定程度的互動。因此，民進黨黨內人士多數看好邱義仁「歸隊」，期盼他再度扮演輔選軍師，發揮選戰謀略、決策和國安事務長才，幫助民進黨奪回政權。蔡英文對此傳言雖未予正面證實，但據指出，雙方已有多次接觸，待職務內容及輔選形式確認後，即可定案。但當媒體就此傳聞詢問蔡英文時，蔡英文則以「哪來的消息」來回應，媒體則指認是因為邱義仁的位置，蔡英文尚未喬定，才有此反問。
顯然，這是民進黨屢試不爽的「放風試探」策略的再次運用，先行放風以傳聞形式來測試政壇的反應，再作定奪。蔡英文之所以要這樣做，是有其苦衷的。一方面，蔡英文極為需要邱義仁為其操盤選戰。因為今次選戰被民進黨支持者賦予極重的期望，是民進黨能否翻身重奪政權的關鍵一戰，倘是失利就將會面臨「三衰而竭」的後果。而且，這次選舉又是「總統」、「立委」選舉合併進行，必須分開兩個班子輔選。蔡英文既是「總統」候選人，必須全力關顧好自己的選情，又是民進黨主席，必須為黨的「立委」選情負責，「蠟燭兩頭燒」。然而，目前已集結的輔選力量，雖然人員不少，但仍然缺乏一個能總館全局的靈魂人物，並由於謝長廷派系已經全力擺放在「立委」選舉中，就使得輔選「總統」的力量，人數雖多缺不夠精幹。環顧民進黨內，只有邱義仁才具備統領選戰大軍的能力。因此，蔡英文是極為希望邱義仁能為她運籌帷幄。
但另一方面，倘若起用邱義仁，卻有許多顧忌。其一是邱義仁身上揹負著「巴新弊案」，被列為被告，雖然黨內很多人都認為他是清白的，但在選戰中卻極有可能會成為馬團隊的攻擊靶子；其二是邱義仁的戰法有時是極端的，如「割喉戰」、「兩顆子彈」等，這與蔡英文的理性風格可能會有扞格；其三是邱義仁與謝長廷、李登輝之間有很深的嫌隙，蔡英文如重用他，是否會得罪了謝長廷、李登輝，從而導致得不償失？其四是部分「獨派」人士也對邱義仁頗有意見，認為民進黨的江山是「成也邱義仁，敗也邱義仁」。在陳水扁後期的許多失誤，如「烽火外交」惹怒了美國，「國務機要費秘密外交」促生貪腐案，導致爆發「紅衫潮」，成為促使民進黨垮臺的最後一根稻草，致使許多「獨派」人士對邱義仁很不諒解。蔡英文倘啟用他，會否引起「獨派」人士群起反對？其五是蔡英文的政治歷練仍很稚嫩，是否有足夠能力控制得了邱義仁的極端戰法？
實際上，邱義仁被稱為「新潮流戰略之神」。回顧民進黨創黨以來的歷史和成長過程，邱義仁不但是是重要參與者，也是對黨重大政治決策定位具有影響力的人，是民進黨內少有的「軍師型」的政治人物。他與「新潮流系」另一大老吳乃仁被稱為民進黨內的「兩顆土豆仁」，但兩人都堅持不參選公職，只是「為他人作嫁衣裳」，寧可身居幕後作輔選幕僚運籌帷幄。也許是出自於台灣大學哲學系的訓練，讓邱義仁在選戰中格外冷靜沉默，永遠能在逆境中殺出一條血路，精於計算的他從來不打沒有把握的仗。「新潮流系」在他領導下，雖然人數不是最多，但每次都能藉由合縱連橫獲取派系最大利益。二零零零年「總統」大選，民進黨內有陳水扁、許信良之爭。本來以邱義仁與許信良的關係，「新系」理應支持許信良，但擅長於觀察情勢的邱義仁卻早就看出，民進黨若要獲勝，唯有推出陳水扁才能奮力一搏。於是「新系」全力支持陳水扁，邱義仁還出任競選總部執行總幹事。選戰開打之初，黨內外都不看好陳水扁，但邱義仁卻一早提出「宋楚瑜出局說」，在他沉穩的操盤下，大軍按照既定的節奏進行，不隨對手音樂起舞，終於贏得勝選，這一戰更奠定邱義仁在黨內「頭號軍師」的地位。二零零四年「總統」大選前夕，國民黨還特別找專人研究「邱義仁兵法」，希望從中找弱點，但最後還是敗在他的手下。二零零八年「總統」大選，藍軍並沒有將謝長廷放在眼內，而是集中精力研究邱義仁將會出什麼「怪招」。幸而謝長廷在初選中與「新潮流系」交惡，並在正式競選中排斥「新系」，拒絕包括邱義仁在內的「新系」成員進入其競選總部，否則馬英九將難以應付邱義仁的「怪招」。
但是，民進黨內卻對邱義仁有不同看法。由於邱義仁與謝長廷交惡，致使據說是謝長廷的愛將葉菊蘭的男朋友的詹錫奎（筆名「老包」）所主持的《新台灣》新聞週刊，就經常批評邱義仁，指出就本土政權勝利方程式而言，陳水扁、謝長廷、李登輝等缺一不可；而身為陳水扁頭號軍師的邱義仁卻一貫敵視李登輝、謝長廷，促使陳水扁走上極端性道路，最後衍生本土政權斷送的負面效應。
「老包」還指責說，人們一再吹捧邱義仁是「智多星」、「大內高手」，邱義仁也在相當程度內確信自己是「智多星」、「大內高手」，只是在更多人的眼中，邱義仁某種程度只是小聰明而已，距離政治智慧甚為遙遠，「聰明反被聰明誤」，畢竟邱義仁內鬥內行，而扁政府八年來對美「外交」的績效，應是檢驗邱義仁最好的標的。王崑義也曾為文指出， 邱義仁大智慧沒有，小聰明倒是不少。可惜的是陳水扁竟然誤信這個「頭號軍師」是諸葛亮，結果八年政權「成也邱義仁，敗也邱義仁」，他敗光了民進黨的威信，也讓本土政權從此跌入陰溝裡。其實瞭解邱義仁的人，都知道他的為政手法就是見招拆招，關關難過關關過，所以什麼「烽火外交」，其實不過是短線操作，過一關算一關，從未替本土政權的長治久安去思考。
這就有可能是蔡英文既需要邱義仁，又擔心邱義仁會壞她的好事的矛盾心理的主要原因，難怪蔡英文會舉棋不定。