海峽論壇是在已舉辦三屆的“海西論壇”基礎上發展擴大並更名的。海峽論壇的共同主辦單位有國務院臺灣事務辦公室、商務部、文化部、交通運輸部、工信部、教育部、國家廣電總局、旅遊局、體育總局、全國總工會、全國婦聯、共青團中央、臺盟中央、國務院發展研究中心、海關總署、質檢總局、中國貿促會等10多個部委和福建省人民政府。

舉辦海峽論壇是貫徹落實胡錦濤總書記在紀念《告臺灣同胞書》發表30周年大會上講話的具體舉措。海峽論壇以科學發展觀為知道，依託福建“五緣”優勢，充分發揮海峽西岸經濟區先行先試的前沿平臺作用，廣泛開展兩岸人民交流，形成兩岸多層次的交流合作格局，不斷促進和推動兩岸關係和平發展。

第一屆海峽論壇

2009年5月15日至22日，首屆海峽論壇在廈門、福州、莆田、泉州四地舉行。島內25個縣市、20個界別，兩岸50多個部門、8000臺灣民眾參與交流，活動涵蓋了經貿、文化、社會、宗教、體育、醫藥衛生、少數民族事業等方方面面，規模之宏大、內容之豐富、代表性之廣泛，前所未有。國台辦主任王毅在海峽論壇開幕式上就表示：這是兩岸交往中一件了不起的事情。

本屆論壇不僅以規模取勝，更著力突出“民間性”的特色，兩岸民眾在這個“嘉年華”中平等交流、熱烈互動，每個參與者都能感受到溝通的喜悅。在5月18日舉行的“海峽論壇•縣市主題日”活動上，來自臺灣25個縣市的代表與來自海西四省21個城市的代表共聚一堂，平等對話。談交流謀合作，上演一幕幕互動好戲。

本屆大會還從兩岸民生出發，出臺了八項惠台政策：一、推動大陸企業赴台投資。二、擴大對台產品採購。三、鼓勵和支持有條件的台資企業拓展大陸市場並參與大陸擴大內需的基礎設施和重大工程建設。四、增加大陸居民赴台旅遊。五、推動協商建立兩岸經濟合作機制。六、進一步向臺灣居民開放專業技術人員資格考試項目。七、加強兩岸農業合作平臺建設。八、許可臺灣地區律師事務所在福州、廈門兩地試點設立分支機搆，從事涉台民事法律咨詢服務。

新發佈的相關規定有：商務部、國台辦正式發佈了《關於大陸企業赴臺灣地區投資或設立非企業法人有關事項的通知》；交通運輸部宣佈了關於進一步促進兩岸海上直航的九項政策措施、《打造“小三通”黃金旅遊通道合作宣言》、國家質檢總局推出《國家質檢總局關於進一步支持海峽西岸經濟區建設的意見》等。

第二屆海峽論壇

2010年6月19日至25日，以“擴大民間交流、加強兩岸合作、促進共同發展”為主題的第二屆海峽論壇在福建省舉辦。本屆論壇主會場設在廈門市，分會場根據論壇內容和活動項目安排在其他8個設區市，共吸引來自臺灣工會、青年、婦女、文化、體育、工商、農業、旅遊等30個界別的萬余名嘉賓參會。

本屆海峽論壇圍繞“聚焦民生、惠澤兩岸”議題，設置了開幕式暨綜藝晚會和論壇大會、政策研討、兩岸文化藝術交流、民間民眾嘉年華4大板塊25場活動，主辦單位多達62家。第二屆海峽論壇更加突出其“民間性、廣泛性、社會性”。從參加論壇的萬名臺灣同胞來看，更多的是來自民間的基層民眾，其中來自島內最基層鄉鎮、村裏的普通民眾占了八成，中南部鄉親約占六成，許多人從未來過大陸，打破了去年8000人紀律。其活動主角是兩岸百姓，開展基層各界別的對口聯誼。比如，在漳州的開漳聖王及部署後裔回漳謁祖進香活動上，4對漳台開漳聖王廟宇對接“兄弟廟”、“義結金蘭”，漳州與臺灣“十姓百村”成功聯誼對接；21日-22日在三明舉行的海峽兩岸鄉鎮對口交流大會，是本屆論壇最有特色的兩岸基層鄉鎮對接交流活動。

第三屆海峽論壇

2011年6月10日至17日，第三屆海峽論壇在福建省9個設區市進行。本屆論壇舉辦了大會活動、臺灣特色廟會、兩岸民間信仰和佛教、兩岸文化交流和入島交流等5大板塊13大項活動。臺灣22個縣市、32個界別、上萬鄉親參與了各項活動，其中來自基層的約占90%，來自中南部的約占70%。臺灣特色廟會是本屆海峽論壇的一大亮點，廟會薈萃臺灣10個縣市的名品特產，近200種臺灣特色小吃及近千種特色產品令人目不暇接。展演閩台民間藝術，內容豐富多彩，參加廟會的民眾飽覽臺灣民俗風情。台中市九天民俗技藝團、桃園縣和成八音藝術團、雲林縣電音三太子樂隊、臺灣少數民族表演隊與福建廈門、漳州、龍岩、泉州等地民間演藝人員同台進行了精彩的表演。廟會舉行期間，參觀總人數超過160萬人次。

本屆論壇推出的惠台新舉措有：第一，積極實施方便兩岸人員交往的措施。6月28日，兩岸將正式啟動大陸居民赴台個人遊的第一批試點。兩岸雙方商定大幅增加客運航班，使班次總量每週達到558班，一舉增加50%以上；第二，7月1日起，大陸方面講全面下調臺胞來大陸簽注收費標準，總體降幅達50%。8月1日起，增加四川省公安機關為在大陸的臺胞補發、換發5年有效臺胞證；在哈爾濱、徐州、煙臺機場口岸增設臺胞簽注點。第三、建立臺灣農產品銷往大陸的穩定、專業、高校的貿易平臺，實現對台農產品採購的常態化；大陸電子視像行業協會將於6月中旬再次組團赴台集中採購。大陸于11月1日施行新修訂的《個體工商戶條例》，明確規定臺灣地區居民可以在大陸申請登記為個體工商戶。大陸有關部門已經同意，臺灣居民可以參加大陸專利代理人資格考試。第四、大陸方面希望儘快簽署《兩岸投保協議》，以積極的態度推進ECFA的後續商談，加強兩岸食品安全領域的溝通、協調與合作，強化監督查驗，嚴厲打擊各種違法犯罪行為。

第四屆海峽論壇

2012年6月16日至22日，第四屆海峽論壇以“擴大民間交流，加強兩岸合作，促進共同發展”為主題，在福建舉行。

本屆論壇突出“彙聚民意，共謀福祉”，共設5大板塊29項活動。大陸各有關主管部門共宣佈了八個方面對台惠民新舉措。

一、人力資源和社會保障部決定，進一步放寬在大陸畢業的臺灣學生及其他臺灣居民在大陸就業的相關政策。一是大陸企業可自主招用台生及其他臺灣居民就業。二是擴大在大陸畢業的台生及其他臺灣居民到大陸事業單位就業試點。三是加強對在大陸畢業的台生及其他臺灣居民的就業服務。

二、國家旅遊局提出進一步擴大大陸居民赴台旅遊的措施，今年爭取推動大陸居民赴台旅遊規模達到180萬人次。一是國家旅遊局將較大幅度增加大陸居民赴台旅遊組團社。二是將擴大赴金馬、馬祖、澎湖地區個人遊範圍。三是國家旅遊局同意臺灣海峽兩岸觀光旅遊協會在上海設立辦事分處。

三、公安部決定進一步為臺灣居民來往大陸和在大陸居留、生活提供便利。一是大陸機場口岸臺灣居民辦理入境證件、簽注點由28個增至31個。二是臺灣居民來往大陸簽注的有效期限將由1年延長至2年。

四、國家質檢總局決定：符合要求的臺灣大米可以輸往大陸，同時啟動臺灣方面提出的其他食品、農產品輸往大陸的相關准入程序。

五、大陸的工商銀行、中國銀行、建設銀行以及國家開發銀行將在未來3到4年內對台資企業再提供6000億人民幣的貸款額度。

六、教育部決定：臺灣居民可以在大陸高校申請教師資格證。

七、國家自然科學基金委和福建省將設立和啟動“促進海峽兩岸科技合作聯合基金”。

八、國台辦將原有11個海峽兩岸交流基地的基礎上，再增設6個基地：福建永定客家文化園、山西運城解州關帝廟、河南固始根親博物館、四川成都大熊貓繁育研究基地、安徽合肥劉銘傳故居、浙江象山縣。

第五屆海峽論壇

2013年6月15日至21日，第五屆海峽論壇在福建舉行。本屆論壇以“聚焦親情，共圓夢想”為主題，設立了4大板塊28項活動。近萬名臺灣同胞與大陸同胞一起敘鄉情，祭先祖，談夢想，議民生，商合作，簽協議，逛廟會……到處洋溢著濃濃的鄉情、友情、親情，到處充滿著歡樂祥和的喜慶氣氛。

以為內共同的媽祖信仰，臺灣千尊媽祖金身回到“媽祖故鄉”湄洲島謁祖進香，兩岸數百家媽祖宮廟4000多名信眾聚湄洲天后廣場同祈兩岸福祉，兩岸青年歌手同台同唱媽祖之歌。

本屆論壇擴大了經貿板塊，由上屆4項增加到7項。在海峽金融論壇上，招商銀行廈門分行等6家銀行與臺灣的永豐商業銀行等6家銀行簽訂了人民幣結算清算合作協議，廈門國際金融管理學院與臺灣金融研訓院就兩岸金融人才聯合培訓簽署合作協議。同期舉行的兩岸特色鄉村對接暨農民合作組織發展交流會上，50對兩岸農民合作組織簽訂了對接合作交流協議。論壇還首次舉辦以“弘揚閩南文化，增進合作交流”為主題的世界閩南文化節，充分展現了閩南人“愛拼會贏”的開拓進取、奮發有為精神和閩南文化的世界影響力。

大陸方面發佈了31項對台惠民新政策措施，其中包括：新增授權11個省區市公安機關為在當地的臺灣居民換發、補發5年有效臺胞證、增加向臺灣居民開放10類（項）專業技術人員資格考試、擬就認可和執行臺灣地區鄉鎮市調解委員會出具的民事調解書發佈司法解釋等。

第六屆海峽論壇

2014年6月14日至20日，第六屆海峽論壇在福建舉行。

本屆海峽論壇繼續堅持以“擴大民間交流、加強兩岸合作、促進共同發展”為主題，同時以“和諧發展、幸福兩岸”為主議題，安排了大會活動、基層交流、文化交流、經貿交流等四大版塊18項活動。主會場設在廈門，同期在福建省各區市和平潭綜合實驗區舉行相關活動。

本次論壇突出以下幾個特點：

一是品牌活動設計創新，將舉辦兩岸的特色廟會，“同名村、心連心”聯誼等民間交流活動，增進鄉情和親情。

二是加強基層社團聯誼和青年群體的互動，新增加舉辦兩岸民生