被稱為「民進黨頭號軍師」、「新潮流戰略之神」的邱義仁，在長期「沉潛」之後，昨日終於「浦頭」。藉著應邀至「微微笑廣播電台」，擔任陳水扁所主持的「有夢上水」節目嘉賓的機會，既揭開了幾個謎團，包括「兩顆子彈」事件發生後主持記者會時他「那一抹神秘微笑」，也談了對「台灣獨立」的看法等。不但是為了自己辯解，也自我揭穿了民進黨祭出「台獨神主牌」的騙局。
　　邱義仁早在民進黨成立之前的「黨外」時期，就推動成立黨外編輯作家聯誼會，發動「批康運動」，對康寧祥的議會運動路線提出批判，並與洪其昌、吳乃仁、林濁水等人創辦經營《新潮流》雜誌，積極吸收成員，主張以組織化行動，成立反對黨，以加強民主化的力量，因而在民進黨成立之後，在此基礎之上形成了黨內最大的派系之一的「新潮流系」，在與當時的國民黨政權纏鬥的同時，也與黨內其他派系惡鬥。一路鬥下去，鬥得曾經與其對立的另一最大派系「美麗島系」煙消雲散，也鬥得不少參與創黨的元老陸續離開民進黨。而其則先後兩次在「總統」大選中，擔任陳水扁的總策劃，輔助陳水扁當選及連任。而其本人也曾先後出任民進黨秘書長、「行政院」秘書長、「總統府秘書長」、「國安會」秘書長，因而有「永遠的秘書長」之稱。
　　陳水扁即將卸任時，邱義仁被指控涉入「巴新外交公款侵吞案」，辭去「行政院副院長」一職，聲明退出民進黨及政壇。在回到民間後，又因「安亞專案」、「鐽震案」等指控，遭受長期的司法調查。因而他到高雄市的內門區務農種菜，表面上遠離政治圈。所涉案件經法院陸續判決無罪後，邱義仁至日本京都產業大學及北海道大學擔任訪問學者，時間約一年半。二零一四年蔡英文回任民進黨主席後，邱義仁以顧問身份提供意見。二零一六年大選，蔡英文成為「總統」，民進黨也首度成為「立法院」第一大黨，邱義仁出任亞東關係協會會長。蔡英文組織「執政決策協調會議」，成員納入邱義仁，蔡英文對邱義仁言聽計從，被黨內認為他才是真正的實力人物。
　　邱義仁是民進黨內著名的「獨派」，並聲稱「台獨」和「反核」是民進黨的「神主牌」，還參與「台獨黨綱」的擬撰。一九八九年，邱義仁反對民進黨「美麗島系」大老張俊宏訪問中國大陸，指責張俊宏訪問中國大陸是「出賣台灣」。一九九九年一月三日，「民視」舉辦「跨世紀國家走向系列辯論會」，沈富雄與郭正亮指出修正「台獨黨綱」是民進黨誠實面對自己的作法，林濁水與邱義仁反對修改「台獨黨綱」。不過，陳水扁獲民進黨推出參加二零零零年「總統」大選後，擔心「台獨黨綱」將會嚇走部分選票，而且民進黨的「台獨黨綱」主張以「獨立建國」來推翻「中華民國」，卻又參加「中華民國總統」選舉，會有邏輯上的扞格，因而以邱義仁等「新潮流系」流員為主的擬撰小組，撰寫了《台灣前途決議文》草案，在一九九九年五月八日召開的民進黨「全代會」獲得通過，為民進黨取得執政權打下重要基礎，也成為民進黨主政時的台灣當局處理兩岸問題最高原則。
　　邱義仁長期反對兩岸交流，在民進黨「中國政策大辯論」中，針對時任黨主席的許信良代表「美麗島系」提出的「大膽西進論」，提出「強本漸進論」，進行針鋒相對的爭論。最後雙方各自妥協，互讓一步，達成融合雙方說法的「強本西進論」。陳水扁當選並就任「總統」後，剛當選但尚未就任民進黨主席的高雄市長謝長廷，獲廈門市長朱亞衍邀請前往訪問，陳水扁與邱義仁下令「陸委會」主委蔡英文，全力阻止謝長廷進行台海兩岸城市交流。
　　但去年十月，美國喬治城大學舉辦「二零二零美中對話」網路視訊活動，其中十二日舉行的一場「美國的台灣政策：策略性模糊與亞洲安全的未來辯論」線上討論，邱義仁在討論到有關台灣要宣布「獨立」的問題時，邱義仁卻指出，任何務實的政治人物都必須瞭解，台灣擁有什麼樣的能力？擁有哪些資源？台灣想與美國維持怎樣的關係？很清楚的，台灣任何務實的政治人物不會這麼做，除非瘋了。哪怕民進黨的第一個「總統」陳水扁，最後在最後要做某件事時也會踩煞車。
　　「鐵桿獨派」卻聲稱主張「台獨」是「瘋了」，這個「髮夾彎」轉得也頗為兀然，當時曾經引發熱議，但邱義仁卻繼續「沉潛」，不作任何解釋。直到昨日，他應邀到「微微笑廣播電台」，擔任陳水扁所主持的「有夢上水」節目嘉賓，作為「當事人」的陳水扁詢問起此事時，才首次正式解釋，聲稱他當時在研討會上指的是「宣佈台灣獨立，現在不適當」，對民進黨來說，這是「目標」「理想」，但作為「政府」，則要考量對外關係、國際情勢等各種因素。他還宣稱，台灣要宣佈「獨立」這個事情，要考慮國際形勢、大陸可能的作為……「不要說大陸會打我們，據我的了解，美國根本就不贊成」。
　　這就自我揭露了，民進黨的「台獨神主牌」，是「有賊心無賊膽」的政治口號，平時束之高閣，每逢選舉時抬出來高呼「台獨」的口號，只不過將之當作是騙取選票的工具，連民進黨人自己也不相信，即使是「鐵桿台獨」的邱義仁也是如此。因此，才有《台灣前途決議文》。但是，為了繼續穩住「獨派」，而又拒絕黨內溫和派「廢除台獨黨綱」的提議，並訛稱《台灣前途決議文》已經凍結了「台獨黨綱」。
　　邱義仁作為「新潮流系戰略之神」，對國際形勢尤其是中國共產黨「反獨促統」的決心，當然是了然於胸的。正如他昨日所言，民進黨或其他「獨派」勢力膽敢宣布「台灣獨立」，大陸勢必會啟動《反分裂國家法》的程序，不惜代價地捍衛國土完整、國家統一的利益。而且，也不要指望美國會支援「台獨」事變，因為包括美國在內的主要西方國家，都奉行一個中國原則，不贊成「台獨」；其所推行的某些「友台」政策，只是為了圍遏中國的需要。但當涉及分裂國土的「台獨」問題時，還是遵守一個中國的承諾的。
　　實際上，美國對台政策的主線，是「不統不獨，維持現狀」。雖然不贊成「統一」，擔心會打破「太平洋第一島鏈」，讓「共產主義外溢」，並擔心統一後，兩岸的經濟融合，必然超過美國，並不利於美國維護自己的國際霸權，近年美國要圍遏中國的表現，就是出於此動機。但美國也不允許「台灣獨立」，而引發台海危機，這更不符合美國的全球利益。
　　因此，邱義仁昨日的表白，是自我戳穿民進黨「台獨神主牌」的「紙老虎」外衣。那些曾經被民進黨利用「台獨」作為選舉工具而欺騙的選民們，應該清醒了，不要再被民進黨所利用。而那些「獨派」嗎們更應從此而覺醒，所謂「台獨」只是麻醉自己的鴉片，只是產生自欺欺人的幻覺，永遠不可能會得逞。倘膽敢輕舉妄動，必將在十四億多中國人民用血肉築成的鋼鐵長城面前碰得頭破血流。