林佳龍為蘇貞昌「擋子彈」十多天，在清水隧道恢復通車後，請辭「交通部長」的辭呈正式生效。而神隱了多天的蘇貞昌也終於「蒲頭」，進行「林後」的人事調度，並於前日由「行政院」發言人羅秉成宣布，由原任「交通部」政務次長王國材接任「交通部長」，「交通部」鐵道局長胡湘麟接任政務次長。至於張政源一月退休後，由「交通部」次長祁文中代理，懸缺三個月，林佳龍向「行政院長」蘇貞昌提名人選缺未能填補的台鐵局長，則由王國材提名由現任副局長杜微接任，當即獲得蘇貞昌接納同意。
　　羅秉成在專為宣布「交通部長」任命召開的記者會上指出，王國材在交通領域上的經歷及歷練豐富，從「中央」到地方的交通建設都有貢獻；至於胡湘麟一路從基層做起，對鐵道建設、營運監理等業務熟悉，專業成效有目共睹，兩人經歷完整，有豐富實務經驗，可立即著手台鐵改革。羅秉成又強調，「台鐵改革勢在必行」，「交通部」新團隊有專業的執行力、溝通的協調力及立即上手的行動力，蘇貞昌院長要求新團隊痛定思痛，做到行車安全、財務和員工安定，以及「有車、有票、安全準時到」的服務目標，推動完成台鐵轉型改革，贏回民眾對台鐵的信心。
　　王國材接任「交通部長」，藍綠兩黨都有人反對，但標的不同。其中國民黨表達不滿，主要是針對「台鐵慘劇」事件，作為副部長的王國材也應負有政治責任，即使是無需辭職，也不宜升官，否則不符政治和行政倫理。而在民進黨內，主要是兩個派系有意見，但也不是整個派系，而是派系中的「意見領袖」，其中與林佳龍同屬「正國會」的「立委」陳亭妃，是不滿沒有委任也是屬於「正國會」的林右昌接任「交通部長」，並將之對比前「行政院」發言人丁怡銘「去而復返」領高薪，直嗆蘇貞昌整頓異己，用人唯私；而作為「英系龍頭」的「立委」陳明文，也在「立法院」交通委員會質詢指出，既然林佳龍為了太魯閣號事故負起政治責任，同部會兩位次長王國材、陳彥伯都是政務官，「不是沒有責任，但王國材反而升任？這次人事任命很奇怪」，並直言他「想不透」。
　　如果說，國民黨的批評，是從政治和行政倫理的角度就事論事，較為單純，不帶政治意圖的話，那麼，民進黨內某些派系人士的反彈，則是帶有派系利益的濃濃酸味了。實際上，蘇貞昌這個「不按行政倫理出牌」的動作，實質上是在一片要他也須辭職負責的聲音中，捍衛及鞏固自己的「行政院長」職位。因此，他不但是堅持要起用王國材，而且在林佳龍正式離任「交通部長」，搬掉了「絆腳石」後，當即接納王國材的提名，決定委任杜微接任台鐵局長，與林佳龍提名新局長人選三個月都不予任命，形成鮮明對比。這種做法，與他不屑「瓜田李下」的顧忌，將月前因「萊牛牛肉麵」事件請辭「行政院」發言人的丁怡銘，高升「行政院」十三至十四職等，相當於部長助理至副部長的有給職顧問，享受高薪之舉，以及當朱立倫質疑蘇貞昌跳過部會首長，插手公營行庫董座的人事案時，其「理直氣壯」地回答，這是他的職權所在，要由「行政院長」核定，他一向不盲目蓋章一樣，都是為了強調及維護自己的權力地位。
　　看來，蔡英文在一定程度上是被蘇貞昌「挾持」了。實際上，雖然「行政院」的部會首長任免是院長的職權，但有關任免命令畢竟是由「總統」作出，並刊登在《總統府公報》後才能生效。因此，蘇貞昌是充分利用目前民進黨當局遇到某些政治危機，尤其是即將進行的「公投」，蔡英文擔心難以駕馭複雜局面，傾向於「維穩」，因而對處理台鐵太魯閣號意外事件，希望不要再增添「麻煩」的心理，自作主張的包攬了「交通部」的人事調整案。。而陳明文的不滿，以其與蔡英文的關係密切程度，可以窺見這項人事任命，折射出王國材並非是蔡英文最理想的人選。
　　實際上，民進黨當局目前正面臨將於八月二十八日進行的「公投」的政治危機，擔心倘是與國民黨對抗，可能會激起民眾對民進黨的不滿情緒更為強烈，因而決定不提出對案，只是以向民眾進行解釋說明為主，因而對「行政院」的人事案也不宜輕舉妄動。另外，蔡英文也尚未物色到「行政院長」的適當人選，因為她所理想的人選鄭文燦，其桃園市長的任期尚未完成，在「落跑市長效應」已經發酵之下，民進黨不能自相矛盾，重蹈覆轍。
　　「正國會」最感氣餒及無奈。本來，他們認為在「正國會」會長林佳龍辭職之後，「交通部長」也應由「正國會」成員填補，具體人選是基隆市長林右昌，以維持「正國會」在「中央」部會中的政治實力。但由於林右昌的基隆市長任期尚未完成，也受到「落跑市長效應」的影響，因而不獲蘇貞昌考慮。
　　「新潮流系」就像當初沒有幸災樂禍，參與要求林佳龍辭職的「大合唱」那樣，今次對「交通部」的人事案，也沒有出聲。但兩者的動因不同，前者是因為「正國會」是「新潮流系」的派系鬥爭主要對手，如果參與鞭笞林佳龍，會被視為「派系惡鬥」；而後者則是因為撿了個大便宜，王國材的派系色彩雖然並不太明顯，但畢竟是屬於「新潮流系」的外圍人員，而且還是「新潮流系」元老陳菊的高雄市政府班子重要成員，曾任高雄市政府交通局長，然後在陳菊向「中央」部會及公營企業輸送人才，卡位搶占潮中，由陳菊推薦，出任過公營企業的老董，並晉升「交通部」副部長。因而王國材的晉升「交通部長」，「新潮流系」是「賺到了」。一方面，將「正國會」勢力從「行政院」清除出去，另一方面，「新潮流系」再次在「行政院」成功「插旗」。
　　至於蘇貞昌本人，則是在「新蘇連」已經結盟的基礎上，可以籍此進一步討好「新潮流系」，舒緩「新潮流系」要以鄭文燦取而代之的壓力，甚至是換取日後的權力鬥爭中，「新潮流系」的支持。
　　其實平心而論，安排王國材出任「交通部長」，在客觀上是回歸了以業務技術為考量，不搞政治任命或政治酬庸。實際上，王國材出身於交通專業背景，不像林佳龍是政治任命。而且，王國材有「最佳工具人」之稱，是「救火隊長」，往往被賦予解決重大問題的重任。「行政院」捨政治而強調專業考量，顯然是在回應社會在太魯閣號事故後要求台鐵改革的強大呼聲，也能減少社會批評。應當說，這是民進黨當局在一連串的政治酬庸中，較為實事求是的一次人事任命。