中國國民黨為因應重新執政，計劃再次修改「黨章」。前日，「黨章研修小組」召開第一次會議，在重新審視中常會結構與運作、擴大鼓勵青年參與、強化黨形象與聲譽三大方向上，由下而上擬定「黨章研修草案」後，提報十二月二十二日召開的「臨時全國黨代表大會」討論。「黨章研修小組」第一次會議還決議，自八月二十九日至九月二十二日在各縣市召開黨代表座談會，九月二十四日彙整黨中央與地方意見呈報中央組發會。九月二十九日召開小組第二次會議並擬訂「黨章研修草案」初稿，十月六日召開第三次會議完成「草案」。並將於十月二十四日提報中央工作會議、十月二十八日「中山會報」，並經十一月五日中常會議決後，提報十一月二十二日「臨全會」討論。
國民黨上三次修改「黨章」，其中的二零零零年及二零零四年的兩次，都是在「總統」敗選之後，針對當時的形勢，尤其是淪為在野黨之後，作出的適應性修改；而二零零七年的一次修改，則幾乎是為馬英九參選「總統」，吸引中間選民而「度身訂做」，成為國民黨邁向「本土化」的重要里程碑。今次的修改，則是因應國民黨重新成為執政黨，而再次計劃進行適應性的調整。其中，有關行政官員列為「當然中常委」的修改內容，顯然是針對政府執政三個月來，多次出現府、院、黨、「立法院」黨團各自為政、多頭馬車的情況，而作出的「輔政機制」修訂。當然，也是為了改變早前中常委選舉時，幾乎所有席位都是由黨籍「立委」拿下，行政官員都「榜上無名」，構成了黨的「權力核心」在「立法院」，執政團隊卻被黨團拖著鼻子轉的被動情況。
正因為如此，在國民黨中央宣佈要修改黨章，尤其是其中的一項主要修章內容是「重新審視中央領導結構」，從而確立「輔政機制」時，在「立法院」內即時傳出「黨章」修改內容將增加執政時期「總統」得兼任「黨主席」規定的消息，並表達了既無可奈何，又充滿抵觸情緒的態度。無可奈何的是，既然「總統」得兼任黨主席的構思是來自馬團隊甚至是馬英九本人，他們不敢說一個「不」字。但從王金平到蔡正元、朱鳳芝等「連系」、「吳系」、「王派」「立委」都聲稱，即使如此，馬英九一定要與其他人公平競爭，以建立黨內民主、制度性的規範。
顯然，「立委」們是抓住了「得兼任黨主席」中的「得」字來大做文章。因為在台灣地區的法律習慣，「得」字有兩個讀音，一是「dei」的第三聲，一是「de」的第二聲。前者是「一定要做」的意思，後者則是「可做可不做」之意。如按後者理解，倘馬英九要兼任國民黨主席，就必須與其他有意者進行公平競爭，按現行黨主席產生機制，參加全體黨員的直接選舉。
黨籍「立委」們之所以有此情緒性想法，顯然是針對馬英九當選「總統」後，自信又自負，以為自己的勝選是全靠個人魅力，即使沒有國民黨的輔選也可當選，因而在「組閣」時，將國民黨當作是「秋後扇」，從不與黨中央商量，也不任用輔選有功人士，而寧可委任敵黨中人（如賴幸媛等），還拒絕了黨主席吳伯雄當初為了因應「立委」選舉的「單一選區」新選制、避免「鷸蚌相爭，漁翁得利」，而與親民黨主席宋楚瑜商定，由幾位現役親民黨籍「立委」禮讓國民黨籍候選人，馬英九在當選「總統」後即提名他們作「監察委員」的安排。就此，他們估計，馬英九在黨內的支持度已經驟降，倘是公平競爭參選黨主席，未必會有大前年那樣的選舉結果。
還有另一個引致黨內情緒反彈的權爭背景，就是在前一段時間，馬團隊突然放出要調換黨主席，由朱立倫取代吳伯雄的風聲。這項傳聞，被黨團認為是馬英九「過河拆橋」的鐵證，因而掀起了「護吳」暗湧。不過，據說吳伯雄並不排斥要他退任，但卻是有條件的，就是在明年底的縣市長選舉中，安排他的兒子、黨籍「立委」吳志揚參選桃園縣長。反正，現任黨籍縣長朱立倫要出任黨主席，這也可算是「公平交換」。
但即使如此，「總統」兼任黨主席之議，仍予人「以黨領政」的欠佳感覺。尤其是，李登輝時代的「黨政一把抓」，已讓國民黨嚴重受傷。而陳水扁上台後也曾一度修改民進黨「黨章」，確立「現任總統為本黨黨員，自其就任之日起，為本黨主席，至其卸任之日止」的機制，親自兼任黨主席，結果其所作所為不但引發黨外天怒人怨，即使是在黨內也是普遍觀感不佳，而致後來黨中央換屆時，陳水扁主動地提出不再兼任黨主席。現在馬英九卻是要把糟粕當作是寶貝，是否要步李登輝、陳水扁的後塵？
其實，站在熱衷於「國共平台」的「立委」們的角度，還有更深一層的懮慮，就是擔心一直主張海峽兩會才是兩岸接觸、談判的「一軌」，而「國共平台」只是「二軌」的馬英九，一旦兼任黨主席後，就不會像吳伯雄那樣充分發揮「國共平台」的積極作用，而是冷待以至拆毀「國共平台」。而黨籍「立委」們大多在大陸有投資或生意等經濟利益，「國共平台」的確立，既能達成他們推動兩岸關係和平發展的意願，又能使他們的私人經濟利益得益。故此，他們寧可維護「國共平台」，也不願因馬英九兼任黨主席而可能會危害到「國共平台」的繼續存在。
或許是黨中央、「立院」黨團的這種情緒在擴散蔓延，使直屬黨中央的「黨章研修小組」對「總統兼任黨主席」之議採冷卻態度；也或許是馬英九也已對此有所警覺，主動收回「總統兼任黨中席」之議，故曾一度甚囂塵上的「總統兼任黨主席」之議，最終並未被「黨章研修小組」收納進「黨章研修提綱」之中。屬於「連系」並受到吳伯雄重用的國民黨文傳會主委李建榮，昨日在介紹「黨章研修小組」擬定的三大討論題綱時，還特地指出並沒有包括「總統得否兼任黨主席」在內。